Nanopore测序及分析实战基础培训班【上海 03.14-03.15】
从实践中掌握测序和数据分析技能,真正地上手操作;详细教程和步骤指导;茶歇期间和技术专家零距离沟通的机会;同样适合无生物信息背景的学员。
在Nanopore测序初级培训班中,你将得到来自技术专家提供的全面教程,详细的步骤指导。茶歇期间更是不容错过的和技术支持直接沟通的好机会。
通过实验培训,您将收获:
- 纳米孔长读长高通量测序的理论知识,实例应用案例分析解读;
- 与技术专家面对面交流,得到实时反馈和即时的答疑解惑,更好的对实验进行规划 (实验方案优化和试剂盒选择);
- 亲自动手进行测序文库制备;
- 在实际操作中学会怎样为测序芯片正确上样。
通过数据分析培训,您将获得:
- 分析软件的相关知识,包括基础的指令、碱基识别、参考基因组比对和错误校准等从头至尾的解析。包括软件的下载和安装。
- 对于生物信息学了解较少或零基础的用户:获得数据分析的理论知识,了解相关可用软件;在指导下亲自上机运行数据分析流程;
- 更系统的了解针对Nanopore数据分析的最佳生物信息分析软件的功能和选择;
- 培训过程中会提供云服务器,真正每个人上手的测序芯片上样、实际测序运行操作的机会。
初级实验培训班
纳米孔测序演示、运行快速测序标准实验,使每位参与人员获得使用MinION或GridION的上手实践操作。
时间:2019年03月14日
地点:上海市浦东新区国际医学园区芙蓉花路118弄
报名方式:直接登陆以下网址
https://nanopore.yilimart.com/Group/Service/
课程安排 | |
09:30 - 10:30 | 纳米孔测序介绍 |
10:30 - 10:45 | 茶歇 |
10:45 - 12:00 | 实验计划指导 (试剂盒选用 & 实际案例) |
12:00 - 13:30 | 午餐及答疑 (包含) |
13:30 - 14:30 | 测序芯片上样练习 & 现场演示 |
14:30 - 14:45 | 茶歇 |
14:45 - 16:00 | 在实验室进行快速测序实验 |
16:00 - 17:00 | 设备控制软件MinKNOW & 数据分析软件EPI2ME介绍 |
初级数据分析培训
详细的数据分析软件介绍和使用培训,包含Oxford Nanopore与社区开发的工具,实际操作运行不同分析工作流程。
时间:2019年03月15日
地点:上海市浦东新区国际医学园区芙蓉花路118弄
报名方式:直接登陆以下网址
https://nanopore.yilimart.com/Group/Service/
课程安排 | |
09:30 - 10:30 | 纳米孔测序介绍 |
10:30 - 10:45 | 茶歇 |
10:45 - 12:00 | 全面的基础数据分析和软件培训 |
12:00 - 13:30 | 午餐(包含) |
13:30 - 17:00 | 全面的基础数据分析和软件培训 |
数据分析培训囊括了以下关键的Nanopore数据分析内容:
1. 指令行的要点
2. 使用Guppy软件进行碱基识别
3. 探索经碱基识别后的读长长度和质量得分分布,并根据这些指标进行读长筛选
4. 将筛选的读长比对到参考基因组
5. 使用Tablet可视化比对
6. 使用WUB生成比对统计信息
7. 使用Pomoxis(Miniasm和Racon)进行从头组装
8. 使用QUAST评估组装质量
9. 使用Nanopolish进行组装错误校正
10.使用mummber(dnadiff)比较纠错后的组装质量
11.使用Nanopolish检测甲基化碱基
为更好的帮助每一位Nanopore测序的新手在轻松愉快的氛围中获得快速获得全面、专业的知识,我们将:
1. 根据相关的培训内容,我们将提供培训所需的测序芯片和试剂盒。
2. 培训班包含茶歇和午餐 (与技术专家1-1交流的最佳时机)。
3. 如果你有任何疑问,请及时联系技术支持 support@nanoporetech.com ,我们会为你提供及时的反馈。
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